Kolmannen kammion on yksi neljästä aivokammiot, jotka kommunikoivat toistensa kanssa. Kuten muutkin aivojen kammiot, se on täytetty aivo-selkäydinnesteellä, joka auttaa suojaamaan aivoja vammoilta ja kuljettamaan ravinteita ja jätteitä. Kolmas kammio on kapea onkalo, joka sijaitsee aivojen kahden puolikkaan välissä.
Kolmas kammio lähettää viestejä ja vastaanottaa viestejä sivukammioista, jotka sijaitsevat kolmannen kammion edessä, ja keskiaivojen vesijohdosta, joka sijaitsee suoraan kolmannen kammion takana. Hypotalamus ja talamus sijaitsevat kolmannen kammion sivuilla.
Kolmannen kammion poikkeavuudet liittyvät erilaisiin tiloihin, mukaan lukien vesisuhde, meningiitti ja kammiotulehdus. Hydrokefalus on liiallinen nesteen kertyminen aivoihin. Aivokalvontulehdus on aivojen ja selkäytimen peittävien kalvojen tulehdus, kun taas kammiotulehdus on kammioiden tulehduksellinen tila. Aivokalvontulehdus ja kammiotulehdukset voivat molemmat johtua kammion, myös kolmannen kammion, traumaatikoista, vaikka traumaattinen meningiitti on harvinainen.
Laajentunut kolmas kammio on liitetty psykiatrisiin sairauksiin, kuten skitsofreniaan; Tämän teorian tarkkuutta ei kuitenkaan ole todistettu lopullisesti.
